胃肠道间质瘤是可以穿刺，但需要结合具体情况来定。

胃肠道间质瘤属于胃肠道黏膜下病变，属于低度恶性的肿瘤，起源于胃肠道黏膜下层以及固有肌层。一般情况下如果胃肠道间质瘤瘤体巨大术前无法确诊，需要术前明确诊断时是可以通过超声内镜引导下进行穿刺活检确定病理结果，进一步确定手术方案。

所以，超声内镜引导下的穿刺术是一种有效确诊的手段，但有一定的消化道出血、穿孔的风险操作难度大，这要求术者娴熟的操作技巧对术者要求比较高。因此，需要到大型三甲医院的消化内科就诊，选择经验丰富的超声内镜医生进行穿刺术检查。