肌肉萎缩根据不同的病因以及肌肉萎缩的严重程度，有些情况下是需要进行手术治疗的。

如果肌肉萎缩是由于支配肌肉的神经产生了异常或者是损害或者是压迫导致的，要对支配的神经来进行恢复功能的治疗，包括神经的吻合修复以及神经的减压，常见的比如由于外伤导致神经的断裂要进行吻合。另外也见于由于间盘突出导致神经根受压，从而出现肌肉的萎缩，要对神经根进行减压治疗，都需要进行手术治疗。

另外，如果肌肉萎缩非常严重了，已经导致肌肉出现变性纤维化、瘢痕、挛缩等病理改变，这种情况下想要完全恢复功能是非常困难的，可以通过对局部肌肉的转位来平衡肌力，从而改善功能障碍的状况。