起床腰疼的处理要避免活动过多。这种疼痛大部分和肌肉酸痛有关系，严重的可以佩戴腰围，避免久坐。应用镇痛的药物，像双氯芬酸钠和布洛芬，以及一些非甾体类消炎镇痛药，阿片类和弱阿片类药物。

腰疼要注意有没有局部的腹痛、尿急、尿痛等情况，排除因为胃肠道炎症，或者泌尿系结石等引起的腰部疼痛和放射痛。去正规的医院进行检查，对症应用抗感染、排石等治疗。还要注意排除一些骨科疾病，像腿部疼痛、走路跛行等，这种情况需要注意检查腰椎。

也要注意睡觉时避免潮湿阴凉的环境，不要床铺太软，以免在睡觉时加重肌肉紧张，出现起床后腰疼的情况。