乙肝疫苗三针可以在不同的地方打，比如左右两侧的胳膊交替进行注射。乙肝疫苗主要是用于预防乙肝疾病，注射时是以肌肉注射为主，最为常见的部位就是上臂三角肌。

有一部分患者是属于新生儿，这一类患者可以在大腿前部外侧的肌肉进行注射。在注射乙肝疫苗时可以左右两侧交替进行注射，不管是左上臂的三角肌还是右上臂的三角肌，都是属于肌肉注射，因此对于乙肝疫苗的功效不会造成影响。

在注射乙肝疫苗时最好是完成整个注射疗程，也就是说三针全部注射完，如果单单只是注射一针会影响到抗体的产生，而达不到预防乙肝的目的。