肛周脓肿既然已经破溃流脓，可先口服或静脉滴注抗菌药物进行抗感染治疗。如果随着抗感染治疗的进行，脓腔逐渐缩小直至愈合，说明肛周脓肿不与肛内相通，已经治愈了。

如果随着抗感染的治疗进行脓腔逐渐缩窄呈管状，肛门周围皮肤可见遗留一个外口，说明此时形成了肛瘘。肛瘘是肛周脓肿的后遗症，因其内口位于肛内，反复发生感染，肛瘘就会反复发作，不能自行愈合。

要想根治肛瘘，只有进行手术治疗，将肛瘘切除或肛瘘切开挂线。所以在肛周脓肿破溃后出现反复流脓的情况时，应及时进行手术治疗，以防肛瘘反复发作，迁延不愈，形成瘘管癌。