巴氏腺囊肿一般不会自愈，巴氏腺囊肿主要是由于经期或者分娩后没有做好外阴部清洁卫生，导致巴氏腺管口堵塞使巴氏腺分泌物不能排出，积存在腺体内引起炎症，化脓后逐渐转化为液体形成囊肿。

巴氏腺囊肿如果比较小，没有出现红肿、疼痛等症状一般不需要处理。

但是需要注意做好局部清洁卫生，勤换洗内裤，饮食方面注意清淡饮食，忌食辛辣刺激性食物，如果囊肿比较大出现化脓等情况，需要在医生指导下使用青霉素或者头孢类抗生素消炎治疗。