高位复杂性肛瘘在肛瘘里面属于比较严重，治疗也比较难，术后复发率比较高。首先，高位复杂性肛瘘的瘘管位置比较高，而且瘘管走形复杂，手术中对瘘管的探查比较困难，很有可能会遗漏瘘管或者内口的处理而导致术后复发。

其次，高位复杂性肛瘘会有多个外口或者内口、多根瘘管，手术时创伤比较大。而且瘘管位置偏高，单纯切开有可能会对肛门括约功能造成很大的影响。

所以，要在保证治愈高位复杂性肛瘘的同时又要尽量减少肛门括约肌的损伤，这样就增加了治疗的难度。对于高位复杂性肛瘘，建议患者找经验丰富的肛肠外科医生手术。