甲功五项可以在下午抽血化验。

因为甲功五项中总甲状腺激素、游离甲状腺激素和促甲状腺素的水平相对稳定，没有昼夜节律性，饮食因素影响也不大，所以可以下午化验。

需要注意，如果医院下午不能化验，必须抽完血以后及时分离血清并冷藏保存，否则在第二天化验就会影响结果的准确性。没有什么特殊情况，还是当天抽血当天化验最好，也不用耽误更多时间，一次就诊就可以完成化验和调整治疗方案。