上腭疼的原因有以下几点：

1.饮食因素。进食了过烫、过于坚硬的食物，会对上腭的黏膜产生较强的刺激与损伤，很容易形成溃疡面，同时伴有明显的疼痛，特别是吃东西时症状会加重。

2.口腔内的卫生清洁不彻底，细菌大量滋生后引起感染而出现炎症。炎症会对上腭产生刺激，引起肿痛的现象。

3.上腭长有肿瘤引起，需要进行口腔的拍片检查来诊断。如果确实有肿瘤，需要考虑手术切除治疗。