肛门处有肉球并出现肿胀、疼痛的症状时，在治疗前需要先确定病因。这种情况和肛肠方面的疾病有很大的关系，例如痔疮、肛周脓肿、息肉等。

如果是因为痔疮的原因导致，可以先用药物进行局部熏洗，之后在肛门周围涂抹痔疮药膏，或塞入痔疮栓进行治疗。如果药物治疗效果不是很明显或是患者的病情较重，最好通过手术的方式进行治疗。肛周脓肿引起的，最好去医院进行手术切开引流治疗，而息肉大多建议患者手术切除。

另外，有一部分患有肛门尖锐湿疣的患者，也会有肛门处出现肉球样组织的症状，这种情况要先进行病理学检测，然后选择药物、激光等方式治疗。