肾结石主要通过泌尿系统排出体外，具体的路径是从肾脏经过输尿管、膀胱，最后通过尿道排出。
肾脏是产生尿液的器官，当形成肾结石后，较小的结石可能会随着尿液的流动而移动。输尿管是连接肾脏和膀胱的细长管道，结石在输尿管中移动时，可能会引起输尿管痉挛，从而导致肾绞痛等症状。输尿管有三个生理性狭窄部位，分别是肾盂输尿管连接处、输尿管跨过髂血管处以及输尿管的膀胱壁内段，结石在通过这些狭窄部位时可能会遇到阻碍，但如果结石足够小，在输尿管的蠕动以及尿液的冲刷下，就能够顺利通过输尿管进入膀胱。膀胱是一个储存尿液的器官，结石进入膀胱后，相对来说就比较容易随着尿液的排出而通过尿道排出体外。尿道是尿液排出的最后通道，男性尿道较长且有生理弯曲，女性尿道较短且直，这也使得女性在排出较小结石时可能相对更容易一些。
肾结石能否顺利排出取决于多种因素，包括结石的大小、形状、位置以及患者自身泌尿系统的结构和功能等。一般来说，直径小于6毫米的肾结石有较大的自行排出的可能性。如果结石较大，可能需要借助医疗手段，如体外冲击波碎石、输尿管镜取石术、经皮肾镜取石术等先将结石击碎或取出，然后再通过泌尿系统排出体外。患者的饮水量、运动量等生活方式因素也对结石的排出有影响。增加饮水量可以增加尿液的生成，从而有助于结石的冲刷和排出；适当的运动，如跳绳、跑步等，也可以通过改变身体的姿势和震动，促使结石在泌尿系统内移动，提高排出的几率。
