克氏综合征患者的平均寿命与正常男性相比可能会略有缩短，但具体的平均寿命难以确切给出一个数值，因为其受到多种因素的综合影响。
克氏综合征患者由于多了一条X染色体核型为47，XXY，会出现一系列的健康问题。从生理方面来看，这类患者在青春期可能会出现睾酮水平低下，导致第二性征发育不良，如乳房发育、小睾丸等情况。这可能会增加一些健康风险，例如骨质疏松的风险相对较高，因为睾酮对维持骨密度有一定作用，睾酮水平低可能使骨骼相对脆弱，容易发生骨折等情况，而骨折后的并发症等可能影响患者的寿命。同时，患代谢综合征、糖尿病、心血管疾病的风险也可能高于正常男性。这可能与激素失衡影响代谢功能有关，例如胰岛素抵抗增加等情况，而这些慢性疾病如果控制不佳，随着年龄增长会逐渐影响身体各个器官的功能，从而影响寿命。
从心理社会因素方面来看，克氏综合征患者由于自身性征发育异常等情况，往往可能会面临心理压力，如自卑、焦虑、抑郁等情绪问题。这些心理问题可能导致患者社交障碍，缺乏良好的生活方式，如可能会出现吸烟、酗酒等不良习惯，进一步影响身体健康，间接影响寿命。不过，如果能够早期发现并进行适当的干预，如激素替代治疗改善睾酮水平，对代谢疾病等进行有效的管理，同时给予患者心理支持，患者也可以拥有较好的生活质量并延长寿命。
