牛黄不宜采用湿热灭菌法处理。湿热灭菌通过高温高压蒸汽破坏微生物结构，但牛黄中的有效成分如胆红素、胆酸等对热敏感，高温易导致活性成分降解或结构改变，从而降低药效甚至产生毒性物质。传统中医炮制牛黄多采用阴干、酒制或低温干燥等方法，正是为了避免高温破坏其药理特性。
牛黄作为名贵中药材，主要功效依赖于其天然成分的协同作用。湿热灭菌的典型条件121℃、15-20分钟会加速胆红素氧化分解，使淡黄色药材转为黑褐色，同时胆酸类成分可能发生酯化或脱水反应。实验数据显示，超过60℃持续加热即可造成牛黄中结合型胆酸含量下降30%以上。现代研究更发现，湿热环境会破坏牛黄中具有抗炎作用的蛋白类成分空间结构，这种不可逆的变性直接影响其治疗中风、惊厥等病症的疗效。
实际操作中需注意，牛黄的灭菌应优先选择辐照或环氧乙烷等低温灭菌技术，若必须接触湿热环境，需严格控制温度不超过60℃且时间短于10分钟。药材处理前后需进行成分含量对比检测，特别是胆红素和胆酸类指标的定量分析。储存时需避光防潮，因湿热灭菌后的牛黄更易吸湿结块并加速成分变化。临床使用前建议通过薄层色谱或高效液相色谱法验证关键活性成分的保留率，确保药材安全有效。
