草苁蓉和肉苁蓉的区别是生长环境不同、外观形态不同、药用部位不同、药理作用不同、临床应用不同。具体分析如下：
1.生长环境不同：草苁蓉主要分布于高寒地区的湿地或沼泽地带，对低温环境适应性强，通常生长在海拔较高的区域。肉苁蓉则多见于干旱或半干旱的沙漠、荒漠地区，耐旱能力突出，常寄生在梭梭等植物的根部。两种植物的生长环境差异直接影响其有效成分的积累和药效表现。
2.外观形态不同：草苁蓉植株较为矮小，茎干细弱，表面多呈黄绿色或淡褐色，花序紧凑且花朵较小。肉苁蓉茎干粗壮肥厚，表面多为棕黄色或深褐色，外形呈圆柱状，花序较大且花朵密集。外观差异使得两者在采收和加工时需采用不同方法。
3.药用部位不同：草苁蓉以全草入药，包括茎、叶及花序部分，干燥后整体切段使用。肉苁蓉则以肉质茎为主要药用部位，通常去除花序后切片或切块，干燥后质地坚硬。药用部位的不同导致两者在炮制方法和剂量控制上存在区别。
4.药理作用不同：草苁蓉具有显著的抗疲劳和免疫调节作用，能促进造血功能并改善缺氧耐受能力。肉苁蓉则以补肾壮阳、润肠通便为主要功效，其活性成分对改善性功能障碍和调节肠道蠕动效果显著。两种植物的药理机制差异决定其适应症的不同。
5.临床应用不同：草苁蓉多用于治疗气血不足、体力透支及高原反应相关症状，常配伍补气类药物使用。肉苁蓉主要用于肾阳亏虚引起的腰膝酸软、阳痿早泄及老年便秘，常与温补肾阳药物协同应用。临床需根据具体证型选择合适品种。
草苁蓉和肉苁蓉虽同属补益类药物，但因生态习性、成分组成及作用靶点的差异，在中医辨证施治中需严格区分。合理选用能最大限度发挥药效，避免误用导致疗效不足或资源浪费。
