肝性脑病的蛋白质代谢产物主要包括氨、硫醇、短链脂肪酸、芳香族氨基酸如苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸以及γ-氨基丁酸GABA等。这些物质在肝功能受损时无法被有效代谢，导致其在血液中积累，进而通过血脑屏障影响中枢神经系统功能，诱发肝性脑病的神经精神症状。
氨是肝性脑病中最关键的代谢产物，主要由肠道细菌分解蛋白质产生。正常情况下，氨在肝脏中通过尿素循环转化为尿素排出体外。当肝功能衰竭时，氨无法被有效清除，血氨水平升高，干扰脑细胞能量代谢，抑制神经传导。硫醇是含硫氨基酸如蛋氨酸的代谢产物，具有神经毒性，可加重氨的毒性作用。短链脂肪酸由肠道细菌发酵未吸收的碳水化合物和蛋白质产生，能够抑制脑细胞钠钾泵功能，影响神经信号传递。芳香族氨基酸在肝脏代谢障碍时水平升高，与支链氨基酸比例失衡，促进假性神经递质如章胺、苯乙醇胺的形成，干扰正常神经递质功能。GABA是中枢神经系统的主要抑制性递质，肝功能衰竭时其受体敏感性增加，加剧神经抑制状态。
肝性脑病的蛋白质代谢产物管理需注意限制蛋白质摄入，尤其是动物蛋白，以减少氨和其他毒性物质的生成。临床治疗需结合乳果糖或利福昔明等药物降低肠道氨吸收，必要时补充支链氨基酸纠正氨基酸失衡。监测血氨水平及神经症状变化对评估疗效至关重要。避免使用镇静剂等可能加重神经抑制的药物，同时积极治疗原发肝病，改善肝功能是根本措施。
