半夜和早晨咳嗽有痰流黄涕可能是风热犯肺、肺热炽盛、痰热壅肺、肺燥津伤、外感风热未愈等原因导致的。具体分析如下：
1.风热犯肺：风热之邪侵袭肺卫，肺失清肃，肺气上逆则咳嗽。热邪煎灼津液为痰，故有痰。风热之邪熏蒸清道，气血壅滞，故流黄涕。病因多为外感风热邪气，如季节交替时外感风热。患者常伴有发热、微恶风寒、咽痛等症状。风热犯肺证的治疗以疏风清热、宣肺止咳为主，可采用银翘散等方剂加减治疗。
2.肺热炽盛：热邪壅盛于肺，肺失清肃，气逆于上而咳嗽。热盛炼液为痰，痰色黄稠。肺热上熏鼻窍，可见流黄涕。多因外感温热邪气入里化热，或风寒之邪入里化热所致。常伴有发热、口渴、气喘等症状。治疗以清热泻肺为主，可选用麻杏甘石汤等方剂进行加减。
3.痰热壅肺：体内素有痰饮，又感受热邪，或因饮食不节，过食肥甘厚味，蕴而生热，热与痰结，壅阻于肺。肺气失宣则咳嗽，痰热互结则痰液黄稠，肺开窍于鼻，痰热上扰则流黄涕。患者可能还会有胸闷、呼吸气粗等表现。治疗以清热化痰为主，清金化痰汤等方剂可用于治疗。
4.肺燥津伤：燥邪伤肺，肺津受损，肺失滋润，气逆而咳。燥邪伤津，炼液为痰，痰液黏稠。燥邪伤肺，肺窍不利，可出现流涕，若有热邪夹杂则为黄涕。多发生于秋季气候干燥之时，或因久病耗伤肺阴。常伴有咽干口燥、皮肤干燥等症状。治疗以清肺润燥为主，桑杏汤等方剂可作参考。
5.外感风热未愈：外感风热之邪后，若未能彻底治愈，余邪未尽，在半夜和早晨人体正气相对不足时，邪气容易作祟，导致咳嗽、有痰、流黄涕等症状。患者可能之前有风热感冒的病史，仍有低热、头痛等残留症状。继续以疏散风热为治法，可根据具体情况调整用药。
如果出现半夜和早晨咳嗽有痰流黄涕的情况，应及时就医，通过中医的辨证论治准确判断病因，从而采取合适的治疗方法，同时注意休息、饮食清淡、多喝水等，有助于身体的恢复。
