玛咖有可能引起过敏反应，但发生率相对较低。作为一种天然植物，玛咖含有多种活性成分，部分人群摄入后可能出现免疫系统异常反应。过敏体质者或对十字花科植物敏感的人群需特别警惕，因玛咖属于十字花科植物，与西兰花、卷心菜等存在交叉过敏的可能性。
玛咖过敏的典型症状包括皮肤瘙痒、红斑、荨麻疹等皮肤反应，严重时可能出现呼吸道水肿、呼吸困难等全身性过敏反应。部分案例报告显示，食用玛咖后可能出现消化道不适如腹痛、腹泻，这些症状可能与过敏或个体耐受性相关。研究发现，玛咖中的芥子油苷及其分解产物可能成为潜在致敏原，加工过程中蛋白质结构变化也可能影响致敏性。不同品种玛咖的致敏风险存在差异，秘鲁原产地的黑玛咖与红玛咖成分浓度较高，需更谨慎评估过敏风险。
食用玛咖前建议进行小剂量测试，首次尝试后观察24小时身体反应。既往有植物过敏史者应咨询过敏专科医师，必要时进行皮肤点刺试验或血清IgE检测。孕妇、哺乳期女性及自身免疫性疾病患者应避免使用，因免疫调节作用可能带来不确定性风险。出现口唇麻木、咽喉紧缩感等前驱症状时需立即就医，延误处理可能诱发过敏性休克。购买时选择正规渠道产品，避免因农药残留或添加剂导致假性过敏反应。正在服用抗凝药物或激素类制剂者需警惕玛咖可能引发的药物相互作用。
