假两性畸形具有一定的遗传倾向，但具体遗传模式因病因不同而异。这类疾病涉及性发育异常，遗传因素与环境因素共同作用导致表型与染色体或性腺性别不一致。部分病例由单基因突变引起，遵循孟德尔遗传规律，如5α-还原酶缺乏症属于常染色体隐性遗传；另一些则与染色体异常或复杂多基因遗传相关，遗传风险需结合具体病因评估。
假两性畸形的遗传机制复杂多样。雄激素不敏感综合征作为X连锁隐性遗传病，母亲携带突变基因时，男性子代有50%患病风险。先天性肾上腺皮质增生症中21-羟化酶缺乏型属于常染色体隐性遗传，父母均为携带者时子女患病概率达25%。某些病例涉及新发突变或嵌合体现象，这类情况家族再发风险较低。表观遗传修饰异常或孕期外源性激素暴露等非遗传因素也可能导致相似表型，这类情况通常不具遗传性。基因检测结合家族史分析可更准确评估遗传风险。
临床咨询需注意区分不同类型假两性畸形的遗传特点。染色体核型分析、基因测序等技术有助于明确病因。遗传风险评估应基于专业实验室检测结果，避免仅凭临床表现判断。涉及生育规划时建议进行遗传咨询，必要时可考虑胚胎植入前遗传学诊断。环境致畸因素的预防同样重要，孕期应避免接触干扰内分泌的化学物质。治疗方案需多学科协作制定，同时关注患者的心理与社会适应需求。
