乙肝大三阳向乙肝小三阳的演变过程取决于两个方面，一个是抗病毒的作用，另外一个是机体免疫系统的作用。即一个是外来的压力，一个是内在的压力。
乙肝大三阳时病毒是处于上风的，免疫系统是处于劣势的。在这种情况下，乙肝病毒释放的是一个完整的颗粒，也就是乙肝大三阳代表患者病毒复制活跃，传染性相对较强。
在机体免疫系统的压力下，还有在抗病毒药物的作用下，乙肝病毒复制不完全或处于劣势，或为了逃避机体免疫系统的绞杀的杀灭作用，可能会发生一系列变化。这种情况下E抗原的表达减少，E抗体表达出现，此时检测患者就由乙肝大三阳变成了乙肝小三阳。
