胡黄连与黄连的区别是来源不同、药用部位不同、性味归经不同、功效主治不同、化学成分不同。具体分析如下：
1.来源不同：胡黄连为玄参科植物胡黄连的干燥根茎，主产于西藏、云南等高海拔地区；黄连为毛茛科植物黄连、三角叶黄连或云连的干燥根茎，主产于四川、湖北等地。两者虽名称相近，但植物来源完全不同，属于不同科属的药材。
2.药用部位不同：胡黄连以根茎入药，外形细长弯曲，表面灰棕色至暗棕色；黄连同样以根茎入药，但外形多呈鸡爪状或圆柱状，表面黄褐色，断面鲜黄色。两者虽均为根茎，但形态特征差异显著。
3.性味归经不同：胡黄连性寒，味苦，归肝、胃、大肠经；黄连性寒，味苦，归心、脾、胃、胆、大肠经。两者均属苦寒之品，但胡黄连偏重于肝胆及下焦湿热，黄连则长于清心胃之火。
4.功效主治不同：胡黄连擅长退虚热、除疳热、清湿热，多用于小儿疳积、骨蒸潮热及湿热泻痢；黄连以清热燥湿、泻火解毒为主，主治高热神昏、心烦呕吐、痈肿疮毒等实热证。两者虽均能清热，但适应症有明确区分。
5.化学成分不同：胡黄连主要含环烯醚萜类成分如胡黄连苷，具有抗炎保肝作用；黄连以生物碱为主，如小檗碱、黄连碱，具有广谱抗菌及抗心律失常作用。两者活性成分差异决定了药理作用的侧重点不同。
胡黄连与黄连虽名称相似且均属清热药，但从基原到临床应用均存在显著差异。在中医辨证施治时需严格区分，避免混淆。
