霉菌感染能否彻底治好取决于感染类型、部位、严重程度以及个体免疫状态。大多数浅表性霉菌感染通过规范治疗可以完全治愈，但深部或系统性霉菌感染治疗难度较大，尤其对于免疫功能低下人群可能存在复发风险。
霉菌感染的治疗通常需要针对性使用抗真菌药物。皮肤癣菌感染如足癣、股癣等，外用唑类或丙烯胺类药膏多数在2-4周内可痊愈。指甲真菌感染甲癣因药物渗透困难，需口服特比萘芬或伊曲康唑数月，治愈率约60%-80%。黏膜感染如口腔念珠菌病，通过氟康唑等药物可有效控制，但免疫缺陷患者需长期预防性用药。深部感染如侵袭性曲霉病或隐球菌性脑膜炎，需静脉注射两性霉素B或伏立康唑，疗程可能长达数月甚至数年，部分患者可能遗留器官损伤。
治疗霉菌感染需严格遵循医嘱完成全程用药，避免自行停药导致耐药性。保持感染部位清洁干燥，穿透气衣物有助于预防皮肤癣菌复发。糖尿病患者需控制血糖，HIV感染者需通过抗病毒治疗恢复免疫功能。长期使用抗生素或免疫抑制剂的人群应警惕二重感染。若出现反复感染或症状加重，需及时进行真菌培养和药敏试验调整方案。部分慢性感染可能需要联合手术清创或光动力治疗。预防重于治疗，避免接触霉变环境，加强个人卫生是降低感染风险的关键。
