三个月宝宝出现消化不良时，建议在医生指导下使用益生菌或消化酶类药物调节肠道功能，但需避免自行用药。由于婴儿消化系统发育不完善，药物选择需严格遵医嘱，通常优先通过调整喂养方式改善症状，药物仅作为辅助手段。
三个月宝宝消化不良常见表现为吐奶、腹胀、排便异常或哭闹不安。若症状较轻，可尝试减少单次喂奶量、增加喂奶次数，母乳喂养者需注意饮食清淡，奶粉喂养者可咨询医生是否需要更换特殊配方。医生可能推荐枯草杆菌二联活菌颗粒等益生菌，帮助建立肠道菌群平衡；或胰酶肠溶胶囊等消化酶类药物需碾碎服用，但具体剂量和疗程需根据体重及症状调整。部分中成药如婴儿健脾散也可缓解症状，但中药成分复杂，使用前务必确认安全性。
注意事项方面，三个月宝宝用药需格外谨慎。避免使用成人消化药或未经医生指导的偏方，尤其是含阿托品、吗丁啉等成分的药物可能引发严重副作用。服药期间需观察是否出现皮疹、腹泻加重等不良反应，及时停药并就医。若消化不良伴随发热、血便、体重不增等情况，需排除感染或过敏等疾病，而非单纯用药。哺乳期母亲应避免摄入过多油腻或易过敏食物，奶粉冲调需按标准比例，避免过浓或过稀。日常可配合腹部按摩顺时针方向促进肠蠕动，但避免在刚喂奶后操作。
