女性两边的肾隐隐作痛，考虑与尿路感染、肾结石、肾盂肾炎等原因有关。
1.尿路感染。当女性尿路受到细菌或其他病原体感染时，会经输尿管逆行，若感染到肾盂部位，在炎症的反复刺激下可能会引起肾部隐隐作痛，所以女性会误认为是肾部疼痛。
2.肾结石。对于比较小的肾结石女性患者，会在肾盂或肾盏里自由活动，会对肾盂或肾盏的黏膜造成一定刺激，并引起女性两边的肾隐隐作痛。
3.肾盂肾炎。特别是梗阻性肾盂肾炎的女性患者，肾盂受到积水或积脓的刺激，可能会引起肾隐隐作痛。
另外，还有可能是肾小球肾炎导致的。女性两边肾隐隐作痛的原因较多，可以前往医院做相关的检查，明确具体原因，并尽早治疗。
