手术治疗，对于特发性尿钙增多症的结石治疗是可以选择的，除此之外，应多饮水，限制高钙高钠及高草酸盐的饮食，吸收型伴严重血尿或结石者，应予严格的低钙饮食，但对患儿需考虑生长发育需要每天供钙不能低于基础的需要量。

药物治疗可以应用噻嗪类利尿剂，常用氢氯噻嗪，作用是能促进远端肾小管重吸收钙使尿钙恢复正常，并调节甲状旁腺激素至正常水平使肠钙吸收正常，其他药物可应用苄氟噻嗪，能减少尿钙的排出和增加利尿，尿石的治疗应按照泌尿性结石的治疗方法常规进行，同时要防治感染，一定要在医生的指导之下来完成治疗。