跑步腹部两侧疼可能是以下几种原因导致的：

1.如果患者出现跑步腹部两侧疼痛，可能是患者出现肠痉挛引发的。这种疾病不只会使患者出现跑步腹部两侧疼，而且还会导致患者出现恶心、呕吐、食欲下降、身体乏力等症状。

2.如果患者平时经常熬夜、不注意休息，久而久之，也会导致患者出现跑步腹部两侧疼的情况。

3.如果患者平时经常吃烧烤、麻辣烫、可乐、薯片等食物，长时间地饮食不规律，可能会导致患者出现肠胃疾病，从而引发患者出现跑步腹部两侧疼。

因此，如果患者出现了这种情况，可以先通过止痛的药物，进行治疗。如果患者服用药物治疗，并且没有得到明显好转，还要及时去医院进行相关检查，查明引发腹部两侧疼的具体病因，根据相关病因，采取对应的治疗方案。另外，患者在日常生活中，要注意饮食清淡，合理、规范地进行饮食，不要吃辛辣、刺激的食物，以免病情加重。