耳根后面痛的原因：

1.很有可能是因为局部皮肤有皮脂腺囊肿。因为皮脂腺排空不通畅从而继发感染，形成囊性病变，用手触摸可以感觉到明显的凸起，尤其是按压时疼痛会比较明显。如果囊肿感染比较严重，甚至已经形成了脓肿，患者可能会有发热症状。

2.可能是因为耳道炎症疾病引起，例如外耳道炎、中耳炎等，都容易会引起局部淋巴结疼痛。

3.有可能是因为咽喉部有疼痛，而疼痛通过神经反射到耳根部位，所以耳根后会有明显的疼痛症状。