维生素D严重缺乏一般不会引起自然流产的。维生素D严重缺乏也有的是会影响到胎儿的健康发育，但是一般不会直接引起流产的问题。

自然流产或者胚胎停止发育，本身是会存在一定的发生几率的，它主要相关的因素是胚胎自身发生染色体突变的可能，是胚胎自己的质量不好而导致流产。

也有的自然流产的发生是和夫妻双方的染色体异常有关，也有的是因为存在孕妇内分泌功能异常，或者是各种病毒感染的问题，也有的和孕妇血栓前状态、血糖高、免疫功能异常等是有关系的。