直肠癌和肛管癌有很大的区别。首先发生的位置就不相同，直肠癌的发病位置在直肠上，离肛门比较远，而肛管癌的发病位置在齿状线上方，离肛门很近。

其次，直肠癌的病理分型以腺癌为主，而肛管癌以磷状细胞癌为主。治疗起来直肠癌相对来说比较简单，而肛管癌比较困难。

因为肛管癌的手术，必须将肛门及直肠都切除，损伤范围很广，手术很大恢复起来比较困难，预后直肠癌相较于肛管癌比较好。