嗜水气单胞菌感染可以通过多种途径感染，经过进食被细菌污染的食物是主要的感染方式。

嗜水气单胞菌感染主要存在于鱼的体内，人进食含有细菌的鱼后就有感染的风险，肠道感染的患者可以出现腹痛、腹泻的症状。嗜水气单胞菌感染还可以通过皮肤接触感染，人被含有细菌的鱼刺伤也会感染此细菌。

皮肤感染后可以发生细菌性的脓肿，细菌入侵人体后还可以导致心肌炎、脑炎、腹膜炎，全身多个部位都可以发生感染。