如果是急性肠炎，不能打新冠疫苗。如果是慢性肠炎，目前没有服用相关禁忌的药物是可以打新冠疫苗。

新冠疫苗接种时是有一定禁忌证的，如果是正处于疾病的急性期，一般是不建议接种新冠疫苗的。否则很有可能会导致严重的不良反应，还有可能会影响到新冠疫苗的效果。

而且在疾病的急性期一般需要服用药物，例如急性肠炎，一般需要口服抗生素药物，在服用药期间不能够打新冠疫苗。需要先积极治疗肠炎，当肠炎病情痊愈停药之后，再考虑是否接种新冠疫苗。而且在接种疫苗以后，需要观察半小时。