手淫过度阴茎变小了，首先可以前往正规医疗机构做阴茎负压抽吸治疗，通过负压的原理促进阴茎海绵体血液循环，被动地使阴茎勃起，这样可以有效改善手淫引起的阴茎短小症状。

另外，如果手淫过度导致了阴茎海绵体萎缩，影响到了阴茎海绵体正常新陈代谢。这种情况下需要通过手术的方法修复阴茎受损海绵体，才可以改善阴茎短小现象。

阴茎短小康复期间要禁止手淫，避免压迫阴茎，避免长期久坐憋尿，否则会影响阴茎短小症状恢复。