指甲上有凹槽可能为以下几种原因所引起：

1.真菌感染。如果指甲不慎被真菌感染，可导致甲板的颜色发生改变，甲板也容易变形、增厚，伴随时间的推移，可逐渐出现指甲凹槽，这种情况常见于灰指甲。

2.缺乏微量元素。尤其是机体缺乏锌元素或钙元素时，容易造成指甲部位得不到充分的营养供给，时间久了就会导致指甲上出现凹槽。

3.营养不良。如果在平时过度挑食、偏食，导致机体内严重缺乏维生素B族和维生素C，也容易导致指甲跟不上营养，进而在指甲上出现凹槽。