韦格纳肉芽肿是一种病因不明的全身性疾病，最初可为眼部表现包括巩膜炎、角膜炎、视网膜血管阻塞、全葡萄膜炎等。

邻近病变还包括眼眶炎性假瘤、眶蜂窝织炎等表现，主要是由邻近的肉芽肿性鼻窦炎蔓延导致，临床症状有眼红、眼痛、畏光、流泪、视力下降，本病多为双眼先后发病。

巩膜炎表现可为结节性巩膜炎、弥漫性或坏死性巩膜炎，坏死性前巩膜炎和边缘溃疡性角膜炎是本病最严重的眼部病变。

本病也可以引起其它非眼部表现，比如肺炎、肾小球肾炎、关节炎等。