卵巢囊肿如果要行手术将其摘除，一般没有明显的疼痛感觉。这是因为卵巢囊肿通常是行腹腔镜微创手术进行切除，在手术前会全身麻醉，所以在手术过程中，女性不会有任何的疼痛感觉。

等到手术结束以后，女性才会慢慢苏醒。等到苏醒以后，会使用镇痛棒缓解疼痛症状，所以女性在手术以后，也可能没有明显的疼痛。由于是腹腔镜微创手术，手术后恢复比较快，所以很多女性在整个手术治疗过程中，以及手术后都没有明显疼痛。

如果女性卵巢囊肿超过5cm，应该选择尽早手术治疗。