自身免疫性甲状腺炎有可能会影响怀孕，需要注意的是，自身免疫性甲状腺炎的患者可能会出现甲亢或者是甲减的症状。

如果患者症状严重，很有可能会影响怀孕后宝宝的身体健康。另外，当患者体内的甲状腺功能存在异常的情况下，也是比较难怀孕的。

患者一定要及时地去医院进行治疗，缓解症状，等身体内的甲状腺功能正常并且稳定了，这种情况下再进行备孕，以免对孩子的智力，还有孩子的身体发育造成相应的影响。如果患者存在有甲状腺功能减退的情况，可以补充甲状腺素进行替代治疗。