淋巴结芽肿的潜伏期为1-4周，有时可能更长的时间。按照疾病的发展过程，淋巴结芽肿可以分为3期。

1期，主要侵犯生殖器、肛门、直肠以及腹股沟淋巴结。有些患者还表现为直肠炎，患者出现脓血便，肉眼发现直肠粘膜充血、水肿、剥脱，以及肉芽组织的形成，也可出现直肠。阴道瘘以及直肠狭窄的可能。

2期，全身性疾病。患者表现为发热、头痛、关节炎、肝脾肿大、周身不适等相关的症状。

3期，也就是晚期。主要表现为局部受累器官功能损害，以及全身衰弱，有些还可以引起恶变。