女性的子宫内膜增厚通常和卵巢囊肿都没有直接的关系。无论是卵巢巧克力囊肿，还是普通的卵巢囊肿，都不会影响到女性的子宫内膜。

女性出现子宫内膜增厚，有可能是怀孕引起的生理性表现，只是由于刚刚怀孕不久，所以检查彩超看不到有明显的孕囊，只是单纯出现子宫内膜增厚。

可能还需要考虑是女性的卵巢内分泌失调引起的，并没有正常的排卵而导致子宫内膜的增生症，比如多囊卵巢综合征的女性，在长时间不来月经的情况下，可能出现子宫内膜的增厚，并且伴有不规则的阴道流血。