子宫内膜异位以后，确实可能会引起卵巢巧克力囊肿的发生。

但是，卵巢囊肿并不一定是子宫内膜异位症引起，有可能是卵巢分泌的雌孕激素刺激导致，也有可能是因为慢性的盆腔炎症引起。而且有一些女性的卵巢囊肿，可能是由于排卵以后而形成的生理性黄体囊肿，并不是由于子宫内膜异位症引起。

只是对于出现卵巢囊肿后，有进行性加重痛经表现，甚至影响女性生育功能，这时就要考虑可能是出现子宫内膜异位症而产生的卵巢巧克力囊肿。