乳腺囊肿有复发的可能。复发原因主要有以下情况：

首先，对于比较大的乳房囊肿病变，医生才会建议手术治疗。手术过程中，如果不注意手术操作，导致囊肿囊壁残留，并没有完全切除囊肿病变，就可能导致病变复发。这种病变复发主要在手术部位出现复发囊肿。

其次，患者存在多发囊肿，手术切除比较大的囊肿，但比较小的囊肿可能继续发展，在复查时被医生发现，这种情况可能会误认为是囊肿病变复发。

最后，虽然手术完全切除了囊肿病变，如果患者术后不注意保护自己，导致乳房囊肿发生的刺激因素持续存在，可能导致病变复发。