乳腺囊肿在手术后会存在一定的复发率。

由于乳腺囊肿是由表面囊壁以及囊内的液体构成，在手术过程中通常需要将乳腺囊肿的壁完整的去除，然后将囊壁送病理学检查，以明确病变的性质。

如果囊肿的体积比较大或者囊肿存在的位置比较深的时候，手术就会存在一定的难度，在手术过程中就会有可能出现手术切除不彻底，会存在囊壁的残留，残留的囊壁就有可能导致复发等情况发生。这通常是一个比较长的过程，在手术以后短时间内出现囊肿复发的情况比较少见。