滴虫性龟头炎治疗首先需要使用抗生素治疗，一般首选甲硝唑、替硝唑等针对滴虫较为敏感的抗生素治疗，一般需要连续用药10天左右，轻症的滴虫性龟头炎患者可以达到临床治愈。

滴虫性的龟头炎患者一般会在龟头表面形成较多的小溃疡，因此还可以使用乳酸溶液、高锰酸钾溶液等进行清洗龟头和包皮的内侧，清洗完之后可以在龟头上涂抹消炎软膏。

滴虫性龟头炎患者可以并发继发性包茎，如果龟头炎反复发作，应行包皮手术治疗。