半夜肚子两边都疼，可以先采取物理的措施来处理，比如用手按摩或者热敷。如果是女性出现这种情况，多半考虑和妇科附件炎症或者是囊肿、肌瘤等这些病症有关。如果是男性，多半考虑肠道出现了问题。

如果这种情况比较严重，建议患者去医院接受检查，可以做一个腹部B超以及CT或者是其他相关检查，了解清楚原因之后再对症治疗。

在半夜肚子两边都疼的时候，不明确病因，最好不要盲目用药，以免服用药物不对症，加重病情。在平日应该要注意腹部保暖，饮食上也不要太过油腻或者口味太重以及辛辣、刺激性食物。