先天性巨舌症的手术费用，需要根据患者的实际情况来进行分析。患者所处地区不同，选择医院等级不同，手术方式不同，其手术费用会存在很大的差异，通常会从3000元-10000元不等。

该疾病如果并不是非常严重，可以通过局部使用地塞米松，或者口服免疫抑制剂进行治疗。如果已经伴有明显的舌或牙颌畸形，也可以考虑通过手术进行治疗。

除了要切除修整巨舌外，还要尽量恢复咬合关系，所以其治疗相对比较复杂。如果只是考虑单纯的手术费用，通常大约在5000~6000元左右。