脚底痒起水疱，多考虑可能是真菌感染引起的脚气。如果长期穿透气性不好的鞋袜，加上经常进行剧烈运动，鞋袜不经常清洗，使脚部长时间处于潮湿的环境下，就容易受到真菌感染诱发脚气，可表现出脚底瘙痒起水疱的症状。

也可能为脚部湿疹所引起，主要是因为脚部受到某些因素的刺激造成过敏所引起，比如穿化纤布料的袜子，接触塑料、橡胶等化学物品，都可能导致脚部出现过敏性的变态反应，诱发湿疹，可使患者出现脚底起水疱的症状，同时伴有较为明显的瘙痒症状。

因此，针对脚底起水疱、瘙痒症状，应明确诊断诱因，对症治疗和调理。