蹲下起来膝盖疼主要是关节炎造成的，由于年龄、退变及外伤等因素影响下诱发的骨性关节炎，在下蹲过程中造成关节内压力增多、炎性渗出增多而引起疼痛。

也会见于髌骨关节炎造成，由于髌骨与股骨之间的磨损加重后诱发无菌性炎症，下蹲时摩擦加重造成疼痛。还可能是半月板损伤后造成的疼痛，与局部外伤有关。

以上几种情况一般可以通过X线光片及CT等方式检查诊断，在经医生诊断后可以给予消炎镇痛治疗，半月板损伤的要进行修复固定治疗。