诊断先天性的直肠肛管畸形，只需要观察在生产后没有胎粪排出，并且检查后无肛门就能确诊，治疗手段必定需要通过手术治疗，手术方案有多种，需要根据不同新生儿的情况来进行裁定。

治疗的目的主要是为了，能够改善新生儿日后排便的控制功能，先天性肛门直肠畸形属于比较常见的消化道疾病，但由于具体的病理较复杂，类型也比较多样化，因此若发现新生儿有此疾病，就需要及时的进行治疗，否则就会影响一生的生活，严重的时候还会影响新生儿的生命健康，必须及时进行治疗。