双肾积水是由于尿路梗阻所导致，引起尿路梗阻的原因包括结石、肿瘤、炎症以及神经源性疾病等。结石包括肾结石、输尿管结石以及膀胱、尿道结石等，尤其是双侧输尿管结石可以引起双肾积水。

肿瘤包括膀胱癌、前列腺癌、原发性输尿管肿瘤等所引起的尿路梗阻，也可见于邻近脏器，如盆腔恶性肿瘤直接压迫输尿管所导致。炎症性疾病常见的有输尿管结核。神经源性疾病常见的为神经源性膀胱，多见于糖尿病或腰椎病变等所引起。

另外，前列腺增生导致排尿不畅也可引起尿路梗阻，导致双肾积水。