第一首先我们偏头痛的病因尚没有明确，可能与以下因素有关第一个遗传因素大约60%的偏头痛病人有家族史，其亲属出现偏头痛的风险是一般人群的百分之3～6倍，家族性偏头痛患者尚未发现一致遗传规律，反映了不同外显率及多基因遗传特征与环境因素的相互作用。家族性偏头痛是明确的有高度异常外显率的常染色体显性遗传，已定位在1qp13、1q21和1q31等三个疾病基因位点。

第二个大的原因是内分泌和代谢因素本病女性多于男性，多在青春期发病，月经期容易发作，妊娠期或绝经后发作减少或停止。这提示内分泌和代谢因素参与偏头痛的发病。此外，5-羟色胺、去甲肾上腺素、P物质和花生四烯酸等代谢异常也可影响偏头痛发生。饮食与精神因素偏头痛发作可由某些食物和药物诱发，食物包括含酪胺的奶酪、含亚硝酸盐防腐剂的肉类和腌制食品、含苯乙胺的巧克力、食品添加剂如谷氨酸钠（味精），红酒及葡萄酒等。药物包括口服避孕药和血管扩张剂如硝酸甘油等。

另外一些环境和精神因素如紧张、过劳、情绪激动、睡眠过度或过少、月经、强光等都有关系。