绝大多数的肛门直肠周围脓肿会变成肛瘘。肛门直肠周围脓肿简称为肛周脓肿，是由于直肠内肛腺感染扩散至肛管直肠周围间隙，导致间隙内出现化脓性感染所形成。

而直肠内感染的肛腺就称之为肛周脓肿的内口。当肛周脓肿自行破溃或者经手术切开引流后，其破溃口或者手术切开引流处的手术切口会演变成为肛瘘外口。

而原感染的肛腺就成为肛瘘的内口，内口和外口之间会有肛瘘瘘管相连，会表现为肛门周围反复的肿痛以及流脓症状，需要手术治疗才能治愈。