口腔溃疡的病因并不明确，考虑与多种因素综合作用的结果有关，一些患有系统性疾病的患者，容易发生口腔溃疡，主要是通过影响免疫系统，而导致的；有些女性患者往往在月经期容易反复发作口腔溃疡，这可能与体内雌激素量下降有关；有的患者在精神紧张、睡眠不佳的情况下，也可以导致口腔溃疡，考虑与植物神经功能失调有关；身体里缺乏各种微量元素，也是导致口腔溃疡发病的原因之一。